9月21日，環保部與浙江宣布牽手共同建設美麗中國的浙江樣本。當天，全國生態文明建設現場推進會上，環保部與浙江省共同簽訂《踐行“兩山”思想建設美麗中國示范區推廣水專項科技成果協議》，旨在通過部省合作，打破信息孤島、推進數據共享，將國家“十三五”水專項的研究和浙江省“五水共治”的實踐、兩山理論實踐密切結合，建設美麗中國的浙江樣本。
根據協議，“十三五”期間，浙江省將在環保部、國家水專項辦的幫助支持下，竭力推進“十三五”“嘉興項目”和“五水共治”獨立課題的實施，在資金、示范工程等方面全力落實保障，積極推廣水專項兩大技術體系，將水專項科技成果運用于浙江省治水工作，提升治水工作的科技水平，確保各項合作內容落實。
環保部與浙江省將共同推廣水專項科技成果示范應用、共同推進數據共享，實現行政審批事項“最多跑一次”改革、共同推進排污權許可證試點工作，聯動創新，積極探索具有浙江特色的治水新理念、新路徑、新舉措。
通過雙方共同努力，到2020年，水專項科技成果有效支撐并推動浙江省水污染防治技術水平更進一步，浙江省環保審批事項改革“最多跑一次”更快一步，浙江省“五水共治”模式為全國其他省（區、市）水污染防治工作提供經驗和借鑒。
根據協議，合作分為六個方面，涵蓋面廣泛。
共同推進部省共建美麗中國示范區建設。在浙江省共同開展“兩山”理論實踐創新基地等相關政策試點實施，支持浙江省開展生態文明建設示范市縣創建。
共同推進水專項水污染治理和水環境管理等技術體系成果在浙江省的省域推廣，開展排污許可與排污權交易試點工作，助推“兩山”思想實踐示范區與生態文明之都建設。
共同推進浙江省“五水共治”與水專項課題實施，實現太湖流域浙江片示范區河湖水體與飲用水的水質改善目標，支撐浙江省國家“水十條”考核指標全面實現。
共同推進水專項太湖流域“嘉興市水污染協調控制與水源地質量改善項目”與“太湖流域浙江片區五水共治長效管理機制創新與水環境治理技術集成推廣應用課題”的研究與示范工作，建立完善以河長制為核心的“五水共治”組織領導推進機制和考核評價體系。
共同推動信息系統部省對接工作，有效解決數據煙囪、信息孤島等問題，全面推動環保公共數據和政務信息系統整合共享，實踐政府“放管服”，實現環保審批“最多跑一次”。
共同推進水專項對浙江省“五水共治”頂層設計和總體方案編制的技術支撐工作，依托水專項專家成立浙江省“五水共治”總體專家組，協助浙江省深化并鞏固“五水共治”成果。專家組每年在浙江省舉辦水污染防治技術高峰論壇１次，為浙江省政府提供治水領域技術調研報告1份。
水專項，即水體污染控制與治理科技重大專項，是為實現中國經濟社會又好又快發展，調整經濟結構，轉變經濟增長方式，緩解我國能源、資源和環境的瓶頸制約，根據《國家中長期科學和技術發展規劃綱要（2006－2020年）》設立的十六個重大科技專項之一，旨在為中國水體污染控制與治理提供強有力的科技支撐，為中國“十一五”期間主要污染物排放總量，化學需氧量減少１０％的約束性指標的實現提供科技支撐。
一般來說，水專項分三個階段進行組織實施，第一階段目標主要突破水體“控源減排”關鍵技術，第二階段目標主要突破水體“減負修復”關鍵技術，第三階段目標主要是突破流域水環境“綜合調控”成套關鍵技術。水專項是建國以來投資最大的水污染治理科技項目，總經費概算三百多億元，其中中央財政137.30億元，占40％，地方財政及企業投資205.95億元，占60％，配套資金比例為1:1.5。
“十一五”“十二五”期間，浙江省共開展實施“苕溪流域農業面源污染河流綜合整治技術集成與示范工程”等8個課題，對提升區域水質起到了良好效果。
通過這些水專項研究，為浙江凝練了一批農業面源治理成套技術、飲用水源安全保障技術、農村生活污水治理技術等水專項科技成果，為浙江省水環境治理改善、實施“五水共治”提供了技術支撐。經過幾年來，全省上下的不懈努力，目前全省地表水總體水質為良，江河干流總體水質基本良好。
在新近召開的省委十四次黨代會上浙江省委提出，今后五年浙江省要在提升生態環境質量上更進一步、更快一步，努力建設美麗浙江；確保不把違法建筑、污泥濁水、臟亂差環境帶入全面小康；鞏固提升剿滅劣Ⅴ類水成果，全省飲用水源地水質和跨行政區域河流交接斷面水質力爭實現雙達標。
“十三五”期間，浙江省已于今年啟動“嘉興市水污染協調控制與水源地質量改善項目”“湖州南太湖水源供水區飲用水安全保障綜合應用示范（建設口子）”等２個項目（課題）。明年，還將啟動“太湖流域浙江片“五水共治”長效管理機制創新與水環境治理技術集成推廣應用”獨立課題
“隨著浙江省治水工作的深入，水環境保護科技支撐的“短板”日顯突出，鞏固五水共治、提升剿滅劣Ⅴ類水成果、實現水質是當前我們亟需解決的難點。”省環保廳相關負責人介紹，將國家“十三五”水專項的研究和浙江省“五水共治”的實踐、兩山理論實踐密切結合，是一件“多贏”的好事，既可為打造“美麗中國”的浙江樣本提供助力，也可以為全國治水提供科技支撐作示范典型。
